Lab Chip热门:南科大姬生健团队开发新装置提升轴突RNA收集效率
2023-04-19 12:20来源:网络本地 0人已围观
摘要近日,南方科技大学生命科学学院神经生物学系姬生健课题组在学术期刊LabonaChip(LabChip)上在线发表了题为“..._新浪网...
近日,南方科技大学生命科学学院神经生物学系姬生健课题组在学术期刊Lab on a Chip(Lab Chip)上在线发表了题为“Facilitation of axonal transcriptome analysis with quantitative microfluidic devices” 的研究论文。该研究中新设计的定量微流控装置(microfluidic chambers)显著地提高了轴突RNA的收集效率,成功地解决了研究轴突转录组时轴突RNA收集的难题。该研究一发表即被收录进Lab on a Chip 2023热门文章( Lab on a Chip HOT Articles 2023)。
![](http://n.sinaimg.cn/sinakd20230419s/692/w1080h412/20230419/2932-51758b9567df95abb023b67b2841cee3.jpg)
微流控装置是研究神经细胞轴突内RNA的定位以及局部翻译的重要工具。该装置主要用来培养神经细胞,利用该装置内的microgrooves实现神经元轴突与神经元胞体的流体分离,从而能够对轴突进行特异性的处理和测量。不仅如此,该装置还可以用来收集轴突RNA进行转录组分析。但是,使用传统的微流控装置收集轴突RNA时,不仅收集量低,而且很难避免胶质细胞的胞体污染。为了解决这些问题,姬生健课题组和Jaewon Park课题组合作设计了两种新的定量微流控装置,分别是multi-compartmental quantitative bipartite chamber (MQBC)和long quantitative tripartite chamber (LQTC)。
新设计的MQBC和LQTC不仅成功地解决了胞体污染的情况,而且极大地提高了轴突RNA收集效率。与传统的微流控装置相比,使用MQBC和LQTC后RNA收集效率最高可以提高77倍。利用这些装置分别收集了三类不同神经元的轴突RNA(小鼠海马齿状回颗粒细胞、小鼠视网膜神经节细胞以及小鼠背根神经节细胞),并比较了这三类神经元的轴突转录组。因此,这些新设计的定量微流控装置成功地促进了轴突转录组分析,这些装置将成为研究轴突转录组以及轴突局部翻译的重要工具。
![](http://n.sinaimg.cn/sinakd20230419s/776/w1080h496/20230419/0659-69fc37cca75553bd0b08e947553079cb.jpg)
南科大为论文第一单位。姬生健课题组硕士研究生杨卓轩、博士后余君、博士研究生张建、硕士毕业生刘建辉、研究助理王妮佳以及Jaewon Park课题组宋惠雪、叶海霞为该论文的共同第一作者。姬生健与Jaewon Park教授(原单位南方科技大学微电子学院,现单位高丽大学)为论文的共同通讯作者。本研究得到了国家自然科学基金、中国博士后科学基金、深港脑科学创新研究院等经费的支持。
原文链接:
https://pubs.rsc.org/en/content/articlelanding/2023/lc/d2lc01183b
本文经作者投稿发布。
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